晚年的杰斐逊钟情于教育事业，把创立一所大学作为他晚年的仅次于心愿。杰斐逊指出，人民有管理自己事务的能力，但人民由于缺少具体的辨别力，有时也有可能犯错误，因此，必需靠教育来提升他们的判断力。

1818年，弗吉尼亚议会拒绝接受了杰斐逊明确提出的创立一所大学的建议，经费15000美元，并登录了一个委员会专门负责管理研究大学的的组织和选址问题。从此时起，杰斐逊把所有的精力都放到了弗吉尼亚大学的筹设中，甚至连校舍的建筑图都是他临死前绘制的。他还大胆地从欧洲聘用教授，为首人到英国的牛津、剑桥等知名大学物色一流的学者来校任教。杰斐逊在挑选出教授时，不但看学术水平，还要看政治观点，特别是在是法律教授。

杰斐逊纪念堂在他显然，教授必需是一个忠诚的共和主义者，因为他期望自己一手创立的这所大学能培育出有有民主偏向的律师，并通过律师来影响立法机关（在当时，大多数被选进议会的人都是律师），使立法机关偏向民主。为了在家乡竣工这所现代化的大学，在晚年本可以生活得无忧无虑的他卖掉了自己大量的土地和许多心爱的藏书，临死前还背上了沈重的债务。在他的希望下，1824年5月，学校月竣工。

杰斐逊实在，创立弗吉尼亚大学是他一生中最最出色的成就之一，因而将此写到了自己的墓志铭。1826年7月4日，正值美国《独立宣言》公开发表50周年之际，杰斐逊离开了人世。

对他，美国人民大自然十分缅怀。今天，在美国的许多城市都有他的纪念碑，其中有三个最不具代表性：一个是矗立在华盛顿的纪念碑，上面铭刻着“我在上帝的祭坛上悔过誓言，要总有一天赞成一切人类心灵残暴统治者的专制形式”。这是杰斐逊一生为之努力奋斗的目标。

杰斐逊雕像另一个是矗立在圣路易斯安那的纪念碑，它不仅纪念杰斐逊为美国的和平与变革所作的贡献，而且是标志美国研发西部的里程碑。还有一个是矗立在他的故乡蒙蒂塞洛的纪念碑，上面铭刻着他为自己写的墓志铭：托马斯·杰斐逊之墓美国《独立宣言》与《弗吉尼亚宗教自由法规》起草人弗吉尼亚大学创建人帕提亚于此杰斐逊一生中尤为人推崇的是他的民主和权利公平的思想。从早年仍然到去世，他的民主思想既有一贯性，又在大大发展完备。大自然权利说道是杰斐逊民主思想的基础，他坚信人生来就拥有大自然彰显的一切权利，还包括找寻新的居住地，按自己意愿创建新的社会的权利、权利信仰宗教的权利和自治权的权利。

他仍然深信，“只有人的固有的和不能出让的权利是永恒不变的”，这也正是他草拟《独立宣言》和制订弗吉尼亚《宗教自由法规》的缘由。人民主权思想是杰斐逊民主思想的核心。他对人民具有无限的信心，在寄给法国重农学派尼摩尔的信中，他曾说：“我们两个人都爱人人民，但是，你把他们当成幼儿加以珍惜，没保姆你是不坚信他们的，而我则把他们看作大人，他们统治者自己我是安心的。

”尽管他否认多数人有时也不会做出错误的要求，但“人民的欺诈较较少危害”。所以当谢斯武装起义愈演愈烈时，杰斐逊不但不惊慌、不满，反而指出这是一件好事，“它在政治界是适当的，于是以如同暴风雨在自然界是适当的一样”，他还警告说道：“上帝不容许我们在20年中没一次这样的叛变。

”杰斐逊指出，只有确保人民的参政权，才能创建一个民主的社会，“在美国必需让人民参与政府的每个部门，……这是确保长年地和忠心地行使政府权力的唯一办法。”而在这些参政的人民中，只有农民才是“上帝挑选出的公民”，是他的理想的民主共和国最差的社会基础。由此，我们也就不难理解他为什么主张“农业立国”了。

当然，不受时代的局限，杰斐逊的思想也并非完美无缺，他虽然提倡公平原则，主张废止奴隶制，但却指出解放后的奴隶不应移往国外，以免他们蒙羞了主人的血液。在行政事务方面，他指出并不是所有人都能胜任政府的管理工作，只有那些“优秀人才”（即“绅士”、“贵族”）才能替人民行使他们的权利。而且他所谓的人民也并非全体国民，最少妇女和黑人不出其佩。尽管如此，杰斐逊民主思想的最出色贡献毕竟不容驳斥的，他的民主主义纲领增进了美国政治和社会经济的民主化，为美国的民主传统奠下了基础，也仍然是美国人民谋求政治民主和社会变革的思想动力。

正如方纳教授所认为的：“在开国元勋当中，就奠下国家的民主方针来说，没有人比杰斐逊所起的起到更大。

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